Απειλή από την Κρήτη για Παναθηναϊκό

Η κλήρωση της β' φάσης έβγαλε αντίπαλο του Τριφυλλιού, σε διπλούς αγώνες (25 ή 26/9 και 30 ή 31/10), τον Εργοτέλη

Στην Κρήτη, όπου πέρυσι αποκλείστηκε από τον Πλατανιά, θα ταξιδέψει και φέτος ο Παναθηναϊκός, καθώς η κλήρωση του Κυπέλλου Ελλάδας τον έφερε αντιμέτωπο, στη β' φάση, του Εργοτέλη. Με Φωκικό ή Αχαρναϊκός θα παίξει ο κάτοχος του τίτλου, Ολυμπιακός, ενώ ο ΠΑΟΚ θα διασταυρωθεί με Αναγέννηση Καρδίτσας ή Καβάλα. Ντέρμπι Ολυμπιακού Βόλου-Παναχαϊκής προέκυψε στην πρώτη φάση.
Το πλήρες πρόγραμμα των δύο πρώτων γύρων του Κυπέλλου Ελλάδας 2013-14 είναι:

 Α' ΦΑΣΗ (μονοί αγώνες στις 14 και 15/9)
1. Φωκικός-Αχαρναϊκός
2. Ολυμπιακός Βόλου-Παναχαϊκή
3. Γλυφάδα-Καλλιθέα
4. Βύζας Μεγάρων- Χανιά
5. Πανηλειακός-Φωστήρας
6. Ηρακλής Ψαχνών-Παναιγιάλειος
7. Αστέρας Μαγούλας-Επισκοπή
8. Κέρκυρα-Δόξα Δράμας
9. Τύρναβος-Ηρακλής
10. Αναγέννηση Γιαννιτσών-Αιγινιακός
11. Εθνικός Γαζώρου-Νίκη Βολου
12. Απόλλων Καλαμαριάς-Ζάκυνθος
13. Αναγέννηση Καρδίτσας-Καβάλα
14. Πιερικός-Βατανιακός

 Β' ΦΑΣΗ (διπλοί αγώνες στις 25-26/9 και 30-31/10)
15. ΠΑΟΚ-Νικητής 13 (Αναγέννηση Καρδίτσας ή Καβάλα)
16. Παναθηναϊκός-Εργοτέλης
17. Ολυμπιακός-Νικητής 1 (Φωκικός-Αχαρναϊκός)
18. Αστέρας Τρίπολης-Νικητής 4 (Βύζας Μεγάρων ή Χανιά)
19. Νικητής 11 (Εθνικός Γαζώρου ή Νίκη Βόλου)-Πανθρακικός
20. Νικητής 3 (Γλυφάδα ή Καλλιθέα) -ΟΦΗ
21. Νικητής 9 (Τύρναβος ή Ηρακλής) - Ξάνθη
22. Νικητής 2 (Ολυμπιακός Βόλου ή Παναχαϊκή) - Άρης
23. Νικητής 7 (Αστέρας Μαγούλας ή Επισκοπή) - Λεβαδειακός
24. Νικητής 6 (Ηρακλής Ψαχνών ή Παναιγιάλειος) - Βέροια
25. Νικητής 5 (Πανηλειακός ή Φωστήρας) - Ατρόμητος
26. Πλατανιάς-Απόλλων
27. ΠΑΣ Γιάννινα - Νικητής 10 (Αναγέννηση Γιαννιτσών ή Αιγινιακός)
28. Πανιώνιος - Νικητής 12 (Απόλλων Καλαμαριάς ή Ζάκυνθος)
29. Νικητής 8 (Κέρκυρα ή Δόξα Δράμας) - Παναιτωλικός
30. Νικητής 14 (Πιερικός ή Βατανιακός) - Καλλονή